综合实力和声誉来说都是武汉大学更好，录取分数线武汉大学一般也要比湖南大学更高，具体各专业两个大学各有所长，武汉大学强的专业要比湖南大学多，参考教育部官方学科评估结果：
武汉大学各学科在全国的排名
学科名称 ?名次
地球物理学:1?
测绘科学与技术:1?
图书情报与档案管理:1?
马克思主义理论:1
理论经济学:3?
水利工程:3?
口腔医学:3?
公共管理:3?
法学:4?
新闻:4?
世界史:4?
地理:4?
哲学: 5?
生物学:5?
轻工技术与工程:7?
软件工程:7?
数学:8?
中国史:9?
物理:9?
中文:10?
考古学:10?
化学:10?
生态学:10?
政治学:11?
计算机:12?
城乡规划学:12?
工商管理:12?
电气工程:13?
环境科学与工程:14?
建筑学:16?
基础医学:16?
外国语言文学:17?
护理学:17?
应用经济学:18?
土木工程:19?
公共卫生与预防医学:19?
中药学:19?
药学:20?
临场医学:22?
风景园林学:23?
心理学:24?
管理科学与工程:24?
统计学:26?
动力工程及工程热物理:26?
信息与通信工程:26?
机械工程:43
湖南大学在全国的学科排名