海南大学最好的专业有法学、食品科学与工程、农学等。
1、法学专业：
法学专业2008年被教育部确定为第三批高等教育特色专业建设点，2019年被教育部确定为首批国家级一流本科专业建设点。所在法学学科2017年获海南省A类特色重点学科；2018年在国家第四轮学科评估中获B等，在全国法学院校中并列第29位。
以法学学科为核心的文化旅游学科群2018年被教育部确定为特色优势学科；在2020年软科中国大学法学学科排名第18位。
法学专业现在有1门国家级一流本科课程、1门国家级精品课程、1门国家精品资源共享课程、1个国家级教学团队、1个全国大学生校外实践教学基地、1个卓越法律人才教育培养基地。
2、食品科学与工程专业：
本专业以扎实的科学理论、工程技术和实践训练基础为支撑，培养良好的政治文化素质，具有外语及计算机应用的基本能力，系统掌握食品科学与工程领域的基本知识和基本技能。
能在食品的生产、加工、流通及与食品科学与工程有关的教育、研究、进出口、卫生监督、安全管理等部门从事食品或相关产品的科学研究、技术开发、工程设计、生产管理、品质控制、产品销售、检验检疫等方面工作，具有宽广知识面、多领域适应能力的复合型高级专业人才。
3、农学专业：
农学是海南大学办学历史最悠久的专业之一，其前身是始建于1958年的原华南热带作物学院热带作物栽培专业，经历原华南热带作物学院更名为原华南热带农业大学，于1999年调整为农学专业。
于2007年由原华南热带农业大学农学院农学专业和原海南大学生命科学与农学院农学专业合并成海南大学农学专业。海南大学农学专业于2009年入选国家级特色专业，并于2019年入选国家级一流本科建设专业。